Protein–RNA interactions for Protein: Q92484

SMPDL3A, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3a, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3AQ92484 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMPDL3AQ92484 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMPDL3AQ92484 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMPDL3AQ92484 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMPDL3AQ92484 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMPDL3AQ92484 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMPDL3AQ92484 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMPDL3AQ92484 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMPDL3AQ92484 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMPDL3AQ92484 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMPDL3AQ92484 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMPDL3AQ92484 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMPDL3AQ92484 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMPDL3AQ92484 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMPDL3AQ92484 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMPDL3AQ92484 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMPDL3AQ92484 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMPDL3AQ92484 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMPDL3AQ92484 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMPDL3AQ92484 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMPDL3AQ92484 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMPDL3AQ92484 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMPDL3AQ92484 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMPDL3AQ92484 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMPDL3AQ92484 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMPDL3AQ92484 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMPDL3AQ92484 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMPDL3AQ92484 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMPDL3AQ92484 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMPDL3AQ92484 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMPDL3AQ92484 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMPDL3AQ92484 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMPDL3AQ92484 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMPDL3AQ92484 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMPDL3AQ92484 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMPDL3AQ92484 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMPDL3AQ92484 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMPDL3AQ92484 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMPDL3AQ92484 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SMPDL3AQ92484 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMPDL3AQ92484 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SMPDL3AQ92484 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMPDL3AQ92484 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMPDL3AQ92484 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMPDL3AQ92484 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMPDL3AQ92484 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMPDL3AQ92484 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SMPDL3AQ92484 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMPDL3AQ92484 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMPDL3AQ92484 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMPDL3AQ92484 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMPDL3AQ92484 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMPDL3AQ92484 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMPDL3AQ92484 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMPDL3AQ92484 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMPDL3AQ92484 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMPDL3AQ92484 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMPDL3AQ92484 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMPDL3AQ92484 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMPDL3AQ92484 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMPDL3AQ92484 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMPDL3AQ92484 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMPDL3AQ92484 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMPDL3AQ92484 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMPDL3AQ92484 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPDL3AQ92484 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPDL3AQ92484 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPDL3AQ92484 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPDL3AQ92484 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPDL3AQ92484 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPDL3AQ92484 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPDL3AQ92484 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPDL3AQ92484 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPDL3AQ92484 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPDL3AQ92484 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPDL3AQ92484 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPDL3AQ92484 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPDL3AQ92484 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPDL3AQ92484 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPDL3AQ92484 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPDL3AQ92484 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPDL3AQ92484 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPDL3AQ92484 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPDL3AQ92484 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPDL3AQ92484 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPDL3AQ92484 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPDL3AQ92484 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPDL3AQ92484 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPDL3AQ92484 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPDL3AQ92484 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPDL3AQ92484 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPDL3AQ92484 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPDL3AQ92484 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPDL3AQ92484 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPDL3AQ92484 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPDL3AQ92484 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPDL3AQ92484 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPDL3AQ92484 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMPDL3AQ92484 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SMPDL3AQ92484 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms