Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXU2

DNAAF4, Dynein assembly factor 4, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF4Q8WXU2 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms