Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW22

DNAJA4, DnaJ homolog subfamily A member 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJA4Q8WW22 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DNAJA4Q8WW22 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DNAJA4Q8WW22 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DNAJA4Q8WW22 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DNAJA4Q8WW22 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DNAJA4Q8WW22 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DNAJA4Q8WW22 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DNAJA4Q8WW22 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
DNAJA4Q8WW22 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DNAJA4Q8WW22 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DNAJA4Q8WW22 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DNAJA4Q8WW22 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DNAJA4Q8WW22 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DNAJA4Q8WW22 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DNAJA4Q8WW22 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DNAJA4Q8WW22 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
DNAJA4Q8WW22 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
DNAJA4Q8WW22 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DNAJA4Q8WW22 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DNAJA4Q8WW22 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DNAJA4Q8WW22 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DNAJA4Q8WW22 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DNAJA4Q8WW22 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DNAJA4Q8WW22 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DNAJA4Q8WW22 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DNAJA4Q8WW22 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DNAJA4Q8WW22 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DNAJA4Q8WW22 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DNAJA4Q8WW22 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNAJA4Q8WW22 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNAJA4Q8WW22 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNAJA4Q8WW22 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNAJA4Q8WW22 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNAJA4Q8WW22 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNAJA4Q8WW22 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNAJA4Q8WW22 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNAJA4Q8WW22 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNAJA4Q8WW22 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNAJA4Q8WW22 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNAJA4Q8WW22 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNAJA4Q8WW22 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNAJA4Q8WW22 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
DNAJA4Q8WW22 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
DNAJA4Q8WW22 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNAJA4Q8WW22 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNAJA4Q8WW22 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNAJA4Q8WW22 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNAJA4Q8WW22 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNAJA4Q8WW22 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNAJA4Q8WW22 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
DNAJA4Q8WW22 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNAJA4Q8WW22 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNAJA4Q8WW22 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNAJA4Q8WW22 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNAJA4Q8WW22 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNAJA4Q8WW22 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNAJA4Q8WW22 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNAJA4Q8WW22 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNAJA4Q8WW22 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNAJA4Q8WW22 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNAJA4Q8WW22 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNAJA4Q8WW22 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNAJA4Q8WW22 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNAJA4Q8WW22 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNAJA4Q8WW22 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNAJA4Q8WW22 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNAJA4Q8WW22 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNAJA4Q8WW22 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNAJA4Q8WW22 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNAJA4Q8WW22 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNAJA4Q8WW22 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNAJA4Q8WW22 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DNAJA4Q8WW22 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJA4Q8WW22 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJA4Q8WW22 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJA4Q8WW22 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJA4Q8WW22 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJA4Q8WW22 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJA4Q8WW22 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJA4Q8WW22 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJA4Q8WW22 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJA4Q8WW22 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJA4Q8WW22 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJA4Q8WW22 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJA4Q8WW22 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJA4Q8WW22 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJA4Q8WW22 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJA4Q8WW22 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJA4Q8WW22 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJA4Q8WW22 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJA4Q8WW22 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJA4Q8WW22 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJA4Q8WW22 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJA4Q8WW22 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJA4Q8WW22 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJA4Q8WW22 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJA4Q8WW22 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJA4Q8WW22 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJA4Q8WW22 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNAJA4Q8WW22 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms