Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD1

DDX54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX54Q8TDD1 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
DDX54Q8TDD1 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DDX54Q8TDD1 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
DDX54Q8TDD1 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DDX54Q8TDD1 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX54Q8TDD1 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX54Q8TDD1 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX54Q8TDD1 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX54Q8TDD1 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX54Q8TDD1 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX54Q8TDD1 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX54Q8TDD1 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX54Q8TDD1 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX54Q8TDD1 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX54Q8TDD1 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX54Q8TDD1 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX54Q8TDD1 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX54Q8TDD1 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX54Q8TDD1 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX54Q8TDD1 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX54Q8TDD1 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX54Q8TDD1 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX54Q8TDD1 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX54Q8TDD1 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX54Q8TDD1 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX54Q8TDD1 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX54Q8TDD1 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX54Q8TDD1 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX54Q8TDD1 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX54Q8TDD1 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX54Q8TDD1 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX54Q8TDD1 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX54Q8TDD1 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX54Q8TDD1 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX54Q8TDD1 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX54Q8TDD1 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX54Q8TDD1 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX54Q8TDD1 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms