Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF6

AVL9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AVL9Q8NBF6 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
AVL9Q8NBF6 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AVL9Q8NBF6 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AVL9Q8NBF6 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AVL9Q8NBF6 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AVL9Q8NBF6 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
AVL9Q8NBF6 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AVL9Q8NBF6 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AVL9Q8NBF6 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AVL9Q8NBF6 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AVL9Q8NBF6 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AVL9Q8NBF6 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AVL9Q8NBF6 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AVL9Q8NBF6 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AVL9Q8NBF6 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AVL9Q8NBF6 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
AVL9Q8NBF6 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
AVL9Q8NBF6 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AVL9Q8NBF6 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AVL9Q8NBF6 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AVL9Q8NBF6 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AVL9Q8NBF6 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AVL9Q8NBF6 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
AVL9Q8NBF6 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AVL9Q8NBF6 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AVL9Q8NBF6 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AVL9Q8NBF6 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AVL9Q8NBF6 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AVL9Q8NBF6 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
AVL9Q8NBF6 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AVL9Q8NBF6 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AVL9Q8NBF6 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AVL9Q8NBF6 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AVL9Q8NBF6 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AVL9Q8NBF6 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AVL9Q8NBF6 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AVL9Q8NBF6 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AVL9Q8NBF6 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AVL9Q8NBF6 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AVL9Q8NBF6 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AVL9Q8NBF6 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AVL9Q8NBF6 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AVL9Q8NBF6 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AVL9Q8NBF6 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AVL9Q8NBF6 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AVL9Q8NBF6 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AVL9Q8NBF6 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms