Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W8

FAM71D, Protein FAM71D, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71DQ8N9W8 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM71DQ8N9W8 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM71DQ8N9W8 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM71DQ8N9W8 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM71DQ8N9W8 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM71DQ8N9W8 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM71DQ8N9W8 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM71DQ8N9W8 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM71DQ8N9W8 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM71DQ8N9W8 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM71DQ8N9W8 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM71DQ8N9W8 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM71DQ8N9W8 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM71DQ8N9W8 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM71DQ8N9W8 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM71DQ8N9W8 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM71DQ8N9W8 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM71DQ8N9W8 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM71DQ8N9W8 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM71DQ8N9W8 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM71DQ8N9W8 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM71DQ8N9W8 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM71DQ8N9W8 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM71DQ8N9W8 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM71DQ8N9W8 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM71DQ8N9W8 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM71DQ8N9W8 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM71DQ8N9W8 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM71DQ8N9W8 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM71DQ8N9W8 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM71DQ8N9W8 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM71DQ8N9W8 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM71DQ8N9W8 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM71DQ8N9W8 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM71DQ8N9W8 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM71DQ8N9W8 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM71DQ8N9W8 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM71DQ8N9W8 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM71DQ8N9W8 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM71DQ8N9W8 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM71DQ8N9W8 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM71DQ8N9W8 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM71DQ8N9W8 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
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FAM71DQ8N9W8 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM71DQ8N9W8 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM71DQ8N9W8 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
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FAM71DQ8N9W8 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM71DQ8N9W8 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM71DQ8N9W8 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM71DQ8N9W8 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
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FAM71DQ8N9W8 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM71DQ8N9W8 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM71DQ8N9W8 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM71DQ8N9W8 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
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FAM71DQ8N9W8 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
FAM71DQ8N9W8 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
FAM71DQ8N9W8 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
FAM71DQ8N9W8 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
FAM71DQ8N9W8 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
FAM71DQ8N9W8 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
FAM71DQ8N9W8 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
FAM71DQ8N9W8 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM71DQ8N9W8 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM71DQ8N9W8 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM71DQ8N9W8 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM71DQ8N9W8 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM71DQ8N9W8 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM71DQ8N9W8 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM71DQ8N9W8 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM71DQ8N9W8 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM71DQ8N9W8 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM71DQ8N9W8 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM71DQ8N9W8 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM71DQ8N9W8 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM71DQ8N9W8 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM71DQ8N9W8 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM71DQ8N9W8 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM71DQ8N9W8 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM71DQ8N9W8 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM71DQ8N9W8 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM71DQ8N9W8 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM71DQ8N9W8 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM71DQ8N9W8 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM71DQ8N9W8 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM71DQ8N9W8 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM71DQ8N9W8 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM71DQ8N9W8 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM71DQ8N9W8 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM71DQ8N9W8 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM71DQ8N9W8 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM71DQ8N9W8 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM71DQ8N9W8 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM71DQ8N9W8 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM71DQ8N9W8 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM71DQ8N9W8 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
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