Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6G1

LINC00337, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00337, humanhuman

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00337Q8N6G1 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00337Q8N6G1 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00337Q8N6G1 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00337Q8N6G1 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00337Q8N6G1 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00337Q8N6G1 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00337Q8N6G1 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00337Q8N6G1 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00337Q8N6G1 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00337Q8N6G1 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00337Q8N6G1 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00337Q8N6G1 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00337Q8N6G1 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00337Q8N6G1 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00337Q8N6G1 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00337Q8N6G1 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00337Q8N6G1 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00337Q8N6G1 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00337Q8N6G1 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00337Q8N6G1 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00337Q8N6G1 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00337Q8N6G1 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00337Q8N6G1 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00337Q8N6G1 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00337Q8N6G1 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00337Q8N6G1 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00337Q8N6G1 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00337Q8N6G1 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00337Q8N6G1 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00337Q8N6G1 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00337Q8N6G1 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00337Q8N6G1 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00337Q8N6G1 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00337Q8N6G1 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00337Q8N6G1 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00337Q8N6G1 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00337Q8N6G1 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00337Q8N6G1 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00337Q8N6G1 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00337Q8N6G1 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00337Q8N6G1 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00337Q8N6G1 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00337Q8N6G1 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00337Q8N6G1 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00337Q8N6G1 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00337Q8N6G1 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00337Q8N6G1 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00337Q8N6G1 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00337Q8N6G1 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00337Q8N6G1 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00337Q8N6G1 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00337Q8N6G1 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00337Q8N6G1 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00337Q8N6G1 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00337Q8N6G1 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00337Q8N6G1 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00337Q8N6G1 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00337Q8N6G1 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00337Q8N6G1 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00337Q8N6G1 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00337Q8N6G1 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00337Q8N6G1 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00337Q8N6G1 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00337Q8N6G1 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00337Q8N6G1 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00337Q8N6G1 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00337Q8N6G1 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00337Q8N6G1 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00337Q8N6G1 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00337Q8N6G1 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00337Q8N6G1 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00337Q8N6G1 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00337Q8N6G1 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00337Q8N6G1 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00337Q8N6G1 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00337Q8N6G1 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00337Q8N6G1 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00337Q8N6G1 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00337Q8N6G1 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00337Q8N6G1 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00337Q8N6G1 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00337Q8N6G1 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00337Q8N6G1 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00337Q8N6G1 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00337Q8N6G1 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00337Q8N6G1 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00337Q8N6G1 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00337Q8N6G1 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00337Q8N6G1 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00337Q8N6G1 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00337Q8N6G1 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00337Q8N6G1 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00337Q8N6G1 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00337Q8N6G1 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00337Q8N6G1 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00337Q8N6G1 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00337Q8N6G1 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00337Q8N6G1 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00337Q8N6G1 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LINC00337Q8N6G1 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms