Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC6BQ86SZ2 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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