Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3V4

UBE3B, Ubiquitin-protein ligase E3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3BQ7Z3V4 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE3BQ7Z3V4 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE3BQ7Z3V4 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE3BQ7Z3V4 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE3BQ7Z3V4 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE3BQ7Z3V4 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE3BQ7Z3V4 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE3BQ7Z3V4 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE3BQ7Z3V4 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE3BQ7Z3V4 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE3BQ7Z3V4 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE3BQ7Z3V4 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE3BQ7Z3V4 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE3BQ7Z3V4 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE3BQ7Z3V4 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE3BQ7Z3V4 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE3BQ7Z3V4 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE3BQ7Z3V4 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE3BQ7Z3V4 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE3BQ7Z3V4 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE3BQ7Z3V4 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE3BQ7Z3V4 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE3BQ7Z3V4 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBE3BQ7Z3V4 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBE3BQ7Z3V4 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBE3BQ7Z3V4 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBE3BQ7Z3V4 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBE3BQ7Z3V4 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBE3BQ7Z3V4 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
UBE3BQ7Z3V4 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBE3BQ7Z3V4 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBE3BQ7Z3V4 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBE3BQ7Z3V4 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBE3BQ7Z3V4 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBE3BQ7Z3V4 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBE3BQ7Z3V4 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBE3BQ7Z3V4 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBE3BQ7Z3V4 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms