Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
STRCQ7RTU9 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
STRCQ7RTU9 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
STRCQ7RTU9 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
STRCQ7RTU9 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
STRCQ7RTU9 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
STRCQ7RTU9 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
STRCQ7RTU9 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
STRCQ7RTU9 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
STRCQ7RTU9 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
STRCQ7RTU9 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
STRCQ7RTU9 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
STRCQ7RTU9 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
STRCQ7RTU9 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
STRCQ7RTU9 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
STRCQ7RTU9 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
STRCQ7RTU9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
STRCQ7RTU9 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
STRCQ7RTU9 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
STRCQ7RTU9 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
STRCQ7RTU9 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
STRCQ7RTU9 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
STRCQ7RTU9 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
STRCQ7RTU9 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
STRCQ7RTU9 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
STRCQ7RTU9 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
STRCQ7RTU9 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
STRCQ7RTU9 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
STRCQ7RTU9 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
STRCQ7RTU9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
STRCQ7RTU9 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
STRCQ7RTU9 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
STRCQ7RTU9 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
STRCQ7RTU9 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
STRCQ7RTU9 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
STRCQ7RTU9 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
STRCQ7RTU9 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
STRCQ7RTU9 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
STRCQ7RTU9 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
STRCQ7RTU9 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
STRCQ7RTU9 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
STRCQ7RTU9 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
STRCQ7RTU9 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
STRCQ7RTU9 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
STRCQ7RTU9 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
STRCQ7RTU9 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
STRCQ7RTU9 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
STRCQ7RTU9 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
STRCQ7RTU9 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
STRCQ7RTU9 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
STRCQ7RTU9 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
STRCQ7RTU9 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
STRCQ7RTU9 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
STRCQ7RTU9 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
STRCQ7RTU9 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
STRCQ7RTU9 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
STRCQ7RTU9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
STRCQ7RTU9 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
STRCQ7RTU9 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
STRCQ7RTU9 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
STRCQ7RTU9 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
STRCQ7RTU9 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
STRCQ7RTU9 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
STRCQ7RTU9 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
STRCQ7RTU9 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
STRCQ7RTU9 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
STRCQ7RTU9 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
STRCQ7RTU9 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
STRCQ7RTU9 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
STRCQ7RTU9 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
STRCQ7RTU9 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
STRCQ7RTU9 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
STRCQ7RTU9 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
STRCQ7RTU9 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
STRCQ7RTU9 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
STRCQ7RTU9 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
STRCQ7RTU9 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
STRCQ7RTU9 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
STRCQ7RTU9 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
STRCQ7RTU9 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
STRCQ7RTU9 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
STRCQ7RTU9 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
STRCQ7RTU9 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
STRCQ7RTU9 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
STRCQ7RTU9 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
STRCQ7RTU9 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
STRCQ7RTU9 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
STRCQ7RTU9 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
STRCQ7RTU9 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
STRCQ7RTU9 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
STRCQ7RTU9 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
STRCQ7RTU9 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
STRCQ7RTU9 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
STRCQ7RTU9 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
STRCQ7RTU9 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
STRCQ7RTU9 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
STRCQ7RTU9 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
STRCQ7RTU9 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
STRCQ7RTU9 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
STRCQ7RTU9 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms