Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HECW1Q76N89 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HECW1Q76N89 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HECW1Q76N89 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HECW1Q76N89 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HECW1Q76N89 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HECW1Q76N89 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HECW1Q76N89 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HECW1Q76N89 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HECW1Q76N89 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HECW1Q76N89 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HECW1Q76N89 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HECW1Q76N89 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HECW1Q76N89 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HECW1Q76N89 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HECW1Q76N89 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HECW1Q76N89 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HECW1Q76N89 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HECW1Q76N89 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HECW1Q76N89 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HECW1Q76N89 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HECW1Q76N89 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HECW1Q76N89 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HECW1Q76N89 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HECW1Q76N89 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HECW1Q76N89 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HECW1Q76N89 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HECW1Q76N89 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HECW1Q76N89 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HECW1Q76N89 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HECW1Q76N89 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HECW1Q76N89 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HECW1Q76N89 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HECW1Q76N89 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HECW1Q76N89 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HECW1Q76N89 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
HECW1Q76N89 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
HECW1Q76N89 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
HECW1Q76N89 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HECW1Q76N89 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HECW1Q76N89 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HECW1Q76N89 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HECW1Q76N89 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HECW1Q76N89 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HECW1Q76N89 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HECW1Q76N89 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HECW1Q76N89 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HECW1Q76N89 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HECW1Q76N89 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HECW1Q76N89 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HECW1Q76N89 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HECW1Q76N89 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HECW1Q76N89 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HECW1Q76N89 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HECW1Q76N89 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HECW1Q76N89 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HECW1Q76N89 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HECW1Q76N89 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HECW1Q76N89 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HECW1Q76N89 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HECW1Q76N89 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HECW1Q76N89 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HECW1Q76N89 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
HECW1Q76N89 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
HECW1Q76N89 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HECW1Q76N89 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HECW1Q76N89 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
HECW1Q76N89 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC27.26■■□□□ 1.96
HECW1Q76N89 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
HECW1Q76N89 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HECW1Q76N89 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
HECW1Q76N89 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HECW1Q76N89 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
HECW1Q76N89 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HECW1Q76N89 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HECW1Q76N89 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HECW1Q76N89 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HECW1Q76N89 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HECW1Q76N89 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HECW1Q76N89 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HECW1Q76N89 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HECW1Q76N89 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HECW1Q76N89 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HECW1Q76N89 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HECW1Q76N89 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HECW1Q76N89 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HECW1Q76N89 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HECW1Q76N89 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HECW1Q76N89 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HECW1Q76N89 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HECW1Q76N89 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HECW1Q76N89 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HECW1Q76N89 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
HECW1Q76N89 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HECW1Q76N89 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HECW1Q76N89 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HECW1Q76N89 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HECW1Q76N89 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
HECW1Q76N89 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HECW1Q76N89 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms