Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR7

LRRC9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC9Q6ZRR7 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRRC9Q6ZRR7 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRRC9Q6ZRR7 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRRC9Q6ZRR7 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRRC9Q6ZRR7 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRRC9Q6ZRR7 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRRC9Q6ZRR7 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRRC9Q6ZRR7 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRRC9Q6ZRR7 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
LRRC9Q6ZRR7 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRC9Q6ZRR7 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRC9Q6ZRR7 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRC9Q6ZRR7 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRC9Q6ZRR7 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRC9Q6ZRR7 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRC9Q6ZRR7 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRC9Q6ZRR7 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRC9Q6ZRR7 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRC9Q6ZRR7 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRC9Q6ZRR7 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRC9Q6ZRR7 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRC9Q6ZRR7 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRC9Q6ZRR7 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRC9Q6ZRR7 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRC9Q6ZRR7 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRC9Q6ZRR7 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRC9Q6ZRR7 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRC9Q6ZRR7 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRC9Q6ZRR7 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRC9Q6ZRR7 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRRC9Q6ZRR7 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
LRRC9Q6ZRR7 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRRC9Q6ZRR7 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRRC9Q6ZRR7 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRRC9Q6ZRR7 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRRC9Q6ZRR7 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRRC9Q6ZRR7 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRRC9Q6ZRR7 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRRC9Q6ZRR7 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRRC9Q6ZRR7 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRRC9Q6ZRR7 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
LRRC9Q6ZRR7 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRRC9Q6ZRR7 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRRC9Q6ZRR7 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRRC9Q6ZRR7 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
LRRC9Q6ZRR7 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRRC9Q6ZRR7 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRRC9Q6ZRR7 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRRC9Q6ZRR7 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRRC9Q6ZRR7 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRRC9Q6ZRR7 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRRC9Q6ZRR7 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRRC9Q6ZRR7 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRRC9Q6ZRR7 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRRC9Q6ZRR7 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
LRRC9Q6ZRR7 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRRC9Q6ZRR7 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRRC9Q6ZRR7 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRRC9Q6ZRR7 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRRC9Q6ZRR7 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRRC9Q6ZRR7 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRRC9Q6ZRR7 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRRC9Q6ZRR7 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRRC9Q6ZRR7 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRRC9Q6ZRR7 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRRC9Q6ZRR7 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRRC9Q6ZRR7 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRRC9Q6ZRR7 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRRC9Q6ZRR7 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
LRRC9Q6ZRR7 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRRC9Q6ZRR7 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRRC9Q6ZRR7 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRRC9Q6ZRR7 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRRC9Q6ZRR7 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRRC9Q6ZRR7 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRRC9Q6ZRR7 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRRC9Q6ZRR7 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRRC9Q6ZRR7 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRRC9Q6ZRR7 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRRC9Q6ZRR7 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRRC9Q6ZRR7 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRRC9Q6ZRR7 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRRC9Q6ZRR7 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRRC9Q6ZRR7 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRRC9Q6ZRR7 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRRC9Q6ZRR7 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRRC9Q6ZRR7 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRRC9Q6ZRR7 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRRC9Q6ZRR7 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
LRRC9Q6ZRR7 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRRC9Q6ZRR7 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRRC9Q6ZRR7 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRRC9Q6ZRR7 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRRC9Q6ZRR7 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRRC9Q6ZRR7 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRRC9Q6ZRR7 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRRC9Q6ZRR7 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LRRC9Q6ZRR7 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LRRC9Q6ZRR7 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LRRC9Q6ZRR7 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms