Protein–RNA interactions for Protein: Q6XLA1

CASC2, Protein CASC2, isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC2Q6XLA1 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 DSCAML1-203ENST00000527706 6099 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC10.37□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 ITPR2-202ENST00000381340 11405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 AJAP1-202ENST00000378191 11666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms