Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C16orf54Q6UWD8 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms