Protein–RNA interactions for Protein: Q6NX49

ZNF544, Zinc finger protein 544, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF544Q6NX49 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF544Q6NX49 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms