Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVU6

UFSP1, Inactive Ufm1-specific protease 1, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFSP1Q6NVU6 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
UFSP1Q6NVU6 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
UFSP1Q6NVU6 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
UFSP1Q6NVU6 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
UFSP1Q6NVU6 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
UFSP1Q6NVU6 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
UFSP1Q6NVU6 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
UFSP1Q6NVU6 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
UFSP1Q6NVU6 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
UFSP1Q6NVU6 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
UFSP1Q6NVU6 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
UFSP1Q6NVU6 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
UFSP1Q6NVU6 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
UFSP1Q6NVU6 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
UFSP1Q6NVU6 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
UFSP1Q6NVU6 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
UFSP1Q6NVU6 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
UFSP1Q6NVU6 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
UFSP1Q6NVU6 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
UFSP1Q6NVU6 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
UFSP1Q6NVU6 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
UFSP1Q6NVU6 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
UFSP1Q6NVU6 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
UFSP1Q6NVU6 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
UFSP1Q6NVU6 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
UFSP1Q6NVU6 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
UFSP1Q6NVU6 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
UFSP1Q6NVU6 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
UFSP1Q6NVU6 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
UFSP1Q6NVU6 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
UFSP1Q6NVU6 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
UFSP1Q6NVU6 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
UFSP1Q6NVU6 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
UFSP1Q6NVU6 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
UFSP1Q6NVU6 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
UFSP1Q6NVU6 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
UFSP1Q6NVU6 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
UFSP1Q6NVU6 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
UFSP1Q6NVU6 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
UFSP1Q6NVU6 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
UFSP1Q6NVU6 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
UFSP1Q6NVU6 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
UFSP1Q6NVU6 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
UFSP1Q6NVU6 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
UFSP1Q6NVU6 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
UFSP1Q6NVU6 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
UFSP1Q6NVU6 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
UFSP1Q6NVU6 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
UFSP1Q6NVU6 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
UFSP1Q6NVU6 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
UFSP1Q6NVU6 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
UFSP1Q6NVU6 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
UFSP1Q6NVU6 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
UFSP1Q6NVU6 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
UFSP1Q6NVU6 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
UFSP1Q6NVU6 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
UFSP1Q6NVU6 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
UFSP1Q6NVU6 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC13□□□□□ -0.33
UFSP1Q6NVU6 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
UFSP1Q6NVU6 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
UFSP1Q6NVU6 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
UFSP1Q6NVU6 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC13□□□□□ -0.33
UFSP1Q6NVU6 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
UFSP1Q6NVU6 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
UFSP1Q6NVU6 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
UFSP1Q6NVU6 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
UFSP1Q6NVU6 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
UFSP1Q6NVU6 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
UFSP1Q6NVU6 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC13□□□□□ -0.33
UFSP1Q6NVU6 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
UFSP1Q6NVU6 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
UFSP1Q6NVU6 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
UFSP1Q6NVU6 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
UFSP1Q6NVU6 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
UFSP1Q6NVU6 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
UFSP1Q6NVU6 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
UFSP1Q6NVU6 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
UFSP1Q6NVU6 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
UFSP1Q6NVU6 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
UFSP1Q6NVU6 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
UFSP1Q6NVU6 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
UFSP1Q6NVU6 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
UFSP1Q6NVU6 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
UFSP1Q6NVU6 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
UFSP1Q6NVU6 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
UFSP1Q6NVU6 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
UFSP1Q6NVU6 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
UFSP1Q6NVU6 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
UFSP1Q6NVU6 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
UFSP1Q6NVU6 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
UFSP1Q6NVU6 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
UFSP1Q6NVU6 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
UFSP1Q6NVU6 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
UFSP1Q6NVU6 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
UFSP1Q6NVU6 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
UFSP1Q6NVU6 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
UFSP1Q6NVU6 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
UFSP1Q6NVU6 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
UFSP1Q6NVU6 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
UFSP1Q6NVU6 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms