Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ49

SDE2, Protein SDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDE2Q6IQ49 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SDE2Q6IQ49 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SDE2Q6IQ49 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms