Protein–RNA interactions for Protein: Q69YN4

VIRMA, Protein virilizer homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,812 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIRMAQ69YN4 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
VIRMAQ69YN4 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
VIRMAQ69YN4 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VIRMAQ69YN4 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VIRMAQ69YN4 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VIRMAQ69YN4 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VIRMAQ69YN4 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VIRMAQ69YN4 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VIRMAQ69YN4 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VIRMAQ69YN4 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VIRMAQ69YN4 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VIRMAQ69YN4 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VIRMAQ69YN4 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VIRMAQ69YN4 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VIRMAQ69YN4 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VIRMAQ69YN4 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VIRMAQ69YN4 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VIRMAQ69YN4 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VIRMAQ69YN4 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
VIRMAQ69YN4 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
VIRMAQ69YN4 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
VIRMAQ69YN4 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
VIRMAQ69YN4 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
VIRMAQ69YN4 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
VIRMAQ69YN4 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
VIRMAQ69YN4 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
VIRMAQ69YN4 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
VIRMAQ69YN4 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
VIRMAQ69YN4 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
VIRMAQ69YN4 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
VIRMAQ69YN4 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
VIRMAQ69YN4 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
VIRMAQ69YN4 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VIRMAQ69YN4 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VIRMAQ69YN4 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VIRMAQ69YN4 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VIRMAQ69YN4 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VIRMAQ69YN4 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VIRMAQ69YN4 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VIRMAQ69YN4 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VIRMAQ69YN4 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VIRMAQ69YN4 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
VIRMAQ69YN4 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
VIRMAQ69YN4 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VIRMAQ69YN4 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
VIRMAQ69YN4 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
VIRMAQ69YN4 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VIRMAQ69YN4 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VIRMAQ69YN4 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
VIRMAQ69YN4 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VIRMAQ69YN4 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VIRMAQ69YN4 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VIRMAQ69YN4 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VIRMAQ69YN4 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VIRMAQ69YN4 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VIRMAQ69YN4 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VIRMAQ69YN4 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
VIRMAQ69YN4 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
VIRMAQ69YN4 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
VIRMAQ69YN4 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VIRMAQ69YN4 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VIRMAQ69YN4 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
VIRMAQ69YN4 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VIRMAQ69YN4 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
VIRMAQ69YN4 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VIRMAQ69YN4 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VIRMAQ69YN4 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VIRMAQ69YN4 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VIRMAQ69YN4 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VIRMAQ69YN4 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VIRMAQ69YN4 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VIRMAQ69YN4 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VIRMAQ69YN4 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VIRMAQ69YN4 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VIRMAQ69YN4 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VIRMAQ69YN4 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VIRMAQ69YN4 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VIRMAQ69YN4 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VIRMAQ69YN4 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VIRMAQ69YN4 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
VIRMAQ69YN4 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VIRMAQ69YN4 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VIRMAQ69YN4 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VIRMAQ69YN4 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VIRMAQ69YN4 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VIRMAQ69YN4 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VIRMAQ69YN4 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VIRMAQ69YN4 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VIRMAQ69YN4 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VIRMAQ69YN4 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VIRMAQ69YN4 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
VIRMAQ69YN4 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VIRMAQ69YN4 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VIRMAQ69YN4 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VIRMAQ69YN4 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VIRMAQ69YN4 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VIRMAQ69YN4 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VIRMAQ69YN4 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VIRMAQ69YN4 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VIRMAQ69YN4 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms