Protein–RNA interactions for Protein: Q68G74

LHX8, LIM/homeobox protein Lhx8, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX8Q68G74 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LHX8Q68G74 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LHX8Q68G74 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LHX8Q68G74 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LHX8Q68G74 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LHX8Q68G74 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LHX8Q68G74 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LHX8Q68G74 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LHX8Q68G74 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LHX8Q68G74 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LHX8Q68G74 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LHX8Q68G74 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LHX8Q68G74 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LHX8Q68G74 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
LHX8Q68G74 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LHX8Q68G74 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LHX8Q68G74 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LHX8Q68G74 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LHX8Q68G74 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LHX8Q68G74 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LHX8Q68G74 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LHX8Q68G74 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LHX8Q68G74 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LHX8Q68G74 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
LHX8Q68G74 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LHX8Q68G74 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LHX8Q68G74 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LHX8Q68G74 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LHX8Q68G74 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LHX8Q68G74 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LHX8Q68G74 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LHX8Q68G74 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LHX8Q68G74 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LHX8Q68G74 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LHX8Q68G74 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LHX8Q68G74 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LHX8Q68G74 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
LHX8Q68G74 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LHX8Q68G74 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LHX8Q68G74 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LHX8Q68G74 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LHX8Q68G74 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LHX8Q68G74 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LHX8Q68G74 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LHX8Q68G74 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LHX8Q68G74 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LHX8Q68G74 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LHX8Q68G74 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LHX8Q68G74 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LHX8Q68G74 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LHX8Q68G74 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LHX8Q68G74 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LHX8Q68G74 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LHX8Q68G74 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LHX8Q68G74 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LHX8Q68G74 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LHX8Q68G74 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LHX8Q68G74 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LHX8Q68G74 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LHX8Q68G74 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LHX8Q68G74 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LHX8Q68G74 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LHX8Q68G74 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LHX8Q68G74 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LHX8Q68G74 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LHX8Q68G74 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LHX8Q68G74 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LHX8Q68G74 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LHX8Q68G74 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LHX8Q68G74 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LHX8Q68G74 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LHX8Q68G74 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
LHX8Q68G74 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LHX8Q68G74 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
LHX8Q68G74 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LHX8Q68G74 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LHX8Q68G74 AC023442.2-201ENST00000526455 270 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LHX8Q68G74 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LHX8Q68G74 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LHX8Q68G74 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
LHX8Q68G74 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LHX8Q68G74 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LHX8Q68G74 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LHX8Q68G74 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LHX8Q68G74 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LHX8Q68G74 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LHX8Q68G74 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LHX8Q68G74 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
LHX8Q68G74 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
LHX8Q68G74 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LHX8Q68G74 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LHX8Q68G74 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LHX8Q68G74 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LHX8Q68G74 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LHX8Q68G74 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LHX8Q68G74 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LHX8Q68G74 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LHX8Q68G74 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LHX8Q68G74 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LHX8Q68G74 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms