Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LDLRAP1Q5SW96 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms