Protein–RNA interactions for Protein: Q5M7Z0

RNFT1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, humanhuman

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Length 435 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT1Q5M7Z0 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNFT1Q5M7Z0 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNFT1Q5M7Z0 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNFT1Q5M7Z0 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNFT1Q5M7Z0 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNFT1Q5M7Z0 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNFT1Q5M7Z0 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNFT1Q5M7Z0 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNFT1Q5M7Z0 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RNFT1Q5M7Z0 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNFT1Q5M7Z0 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNFT1Q5M7Z0 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNFT1Q5M7Z0 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNFT1Q5M7Z0 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNFT1Q5M7Z0 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNFT1Q5M7Z0 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNFT1Q5M7Z0 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RNFT1Q5M7Z0 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNFT1Q5M7Z0 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNFT1Q5M7Z0 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNFT1Q5M7Z0 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNFT1Q5M7Z0 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNFT1Q5M7Z0 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNFT1Q5M7Z0 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNFT1Q5M7Z0 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNFT1Q5M7Z0 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RNFT1Q5M7Z0 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNFT1Q5M7Z0 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNFT1Q5M7Z0 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RNFT1Q5M7Z0 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNFT1Q5M7Z0 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNFT1Q5M7Z0 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNFT1Q5M7Z0 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNFT1Q5M7Z0 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNFT1Q5M7Z0 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNFT1Q5M7Z0 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNFT1Q5M7Z0 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNFT1Q5M7Z0 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNFT1Q5M7Z0 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNFT1Q5M7Z0 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNFT1Q5M7Z0 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNFT1Q5M7Z0 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RNFT1Q5M7Z0 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RNFT1Q5M7Z0 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNFT1Q5M7Z0 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNFT1Q5M7Z0 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNFT1Q5M7Z0 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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RNFT1Q5M7Z0 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNFT1Q5M7Z0 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNFT1Q5M7Z0 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNFT1Q5M7Z0 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNFT1Q5M7Z0 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNFT1Q5M7Z0 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNFT1Q5M7Z0 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNFT1Q5M7Z0 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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RNFT1Q5M7Z0 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNFT1Q5M7Z0 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNFT1Q5M7Z0 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RNFT1Q5M7Z0 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNFT1Q5M7Z0 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNFT1Q5M7Z0 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNFT1Q5M7Z0 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNFT1Q5M7Z0 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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RNFT1Q5M7Z0 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNFT1Q5M7Z0 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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RNFT1Q5M7Z0 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNFT1Q5M7Z0 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNFT1Q5M7Z0 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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RNFT1Q5M7Z0 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNFT1Q5M7Z0 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNFT1Q5M7Z0 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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RNFT1Q5M7Z0 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNFT1Q5M7Z0 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNFT1Q5M7Z0 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNFT1Q5M7Z0 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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RNFT1Q5M7Z0 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNFT1Q5M7Z0 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNFT1Q5M7Z0 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNFT1Q5M7Z0 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNFT1Q5M7Z0 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RNFT1Q5M7Z0 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNFT1Q5M7Z0 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNFT1Q5M7Z0 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNFT1Q5M7Z0 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNFT1Q5M7Z0 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNFT1Q5M7Z0 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNFT1Q5M7Z0 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNFT1Q5M7Z0 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNFT1Q5M7Z0 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RNFT1Q5M7Z0 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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