Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC27A3Q5K4L6 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms