Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRX3

PITRM1, Presequence protease, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1Q5JRX3 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PITRM1Q5JRX3 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms