Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HSD17B12Q53GQ0 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms