Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C4orf17Q53FE4 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms