Protein–RNA interactions for Protein: Q53EV4

LRRC23, Leucine-rich repeat-containing protein 23, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC23Q53EV4 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LRRC23Q53EV4 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LRRC23Q53EV4 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LRRC23Q53EV4 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LRRC23Q53EV4 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LRRC23Q53EV4 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LRRC23Q53EV4 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LRRC23Q53EV4 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LRRC23Q53EV4 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LRRC23Q53EV4 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LRRC23Q53EV4 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LRRC23Q53EV4 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LRRC23Q53EV4 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LRRC23Q53EV4 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LRRC23Q53EV4 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LRRC23Q53EV4 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LRRC23Q53EV4 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
LRRC23Q53EV4 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LRRC23Q53EV4 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
LRRC23Q53EV4 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LRRC23Q53EV4 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LRRC23Q53EV4 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms