Protein–RNA interactions for Protein: Q504U0

C4orf46, Renal cancer differentiation gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf46Q504U0 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
C4orf46Q504U0 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms