Protein–RNA interactions for Protein: Q4G163

FBXO43, F-box only protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO43Q4G163 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FBXO43Q4G163 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FBXO43Q4G163 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FBXO43Q4G163 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXO43Q4G163 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXO43Q4G163 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXO43Q4G163 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXO43Q4G163 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXO43Q4G163 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXO43Q4G163 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXO43Q4G163 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXO43Q4G163 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXO43Q4G163 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXO43Q4G163 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXO43Q4G163 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXO43Q4G163 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXO43Q4G163 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXO43Q4G163 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXO43Q4G163 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXO43Q4G163 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXO43Q4G163 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXO43Q4G163 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXO43Q4G163 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXO43Q4G163 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXO43Q4G163 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXO43Q4G163 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXO43Q4G163 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXO43Q4G163 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXO43Q4G163 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXO43Q4G163 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXO43Q4G163 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXO43Q4G163 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXO43Q4G163 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXO43Q4G163 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXO43Q4G163 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXO43Q4G163 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXO43Q4G163 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXO43Q4G163 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXO43Q4G163 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXO43Q4G163 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FBXO43Q4G163 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FBXO43Q4G163 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FBXO43Q4G163 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FBXO43Q4G163 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FBXO43Q4G163 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FBXO43Q4G163 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FBXO43Q4G163 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FBXO43Q4G163 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FBXO43Q4G163 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FBXO43Q4G163 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FBXO43Q4G163 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FBXO43Q4G163 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FBXO43Q4G163 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FBXO43Q4G163 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FBXO43Q4G163 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FBXO43Q4G163 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FBXO43Q4G163 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FBXO43Q4G163 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FBXO43Q4G163 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FBXO43Q4G163 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FBXO43Q4G163 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FBXO43Q4G163 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FBXO43Q4G163 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FBXO43Q4G163 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FBXO43Q4G163 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FBXO43Q4G163 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FBXO43Q4G163 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FBXO43Q4G163 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FBXO43Q4G163 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FBXO43Q4G163 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FBXO43Q4G163 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
FBXO43Q4G163 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FBXO43Q4G163 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FBXO43Q4G163 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FBXO43Q4G163 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FBXO43Q4G163 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FBXO43Q4G163 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FBXO43Q4G163 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
FBXO43Q4G163 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FBXO43Q4G163 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FBXO43Q4G163 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FBXO43Q4G163 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FBXO43Q4G163 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
FBXO43Q4G163 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FBXO43Q4G163 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FBXO43Q4G163 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FBXO43Q4G163 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FBXO43Q4G163 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FBXO43Q4G163 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FBXO43Q4G163 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FBXO43Q4G163 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FBXO43Q4G163 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FBXO43Q4G163 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FBXO43Q4G163 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FBXO43Q4G163 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FBXO43Q4G163 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FBXO43Q4G163 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FBXO43Q4G163 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FBXO43Q4G163 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FBXO43Q4G163 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms