Protein–RNA interactions for Protein: Q499Y3

Putative uncharacterized protein C10orf88-like, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q499Y3 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q499Y3 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q499Y3 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q499Y3 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q499Y3 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q499Y3 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q499Y3 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q499Y3 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q499Y3 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q499Y3 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q499Y3 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q499Y3 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q499Y3 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q499Y3 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Q499Y3 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Q499Y3 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q499Y3 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q499Y3 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q499Y3 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q499Y3 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q499Y3 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Q499Y3 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q499Y3 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q499Y3 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q499Y3 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q499Y3 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q499Y3 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q499Y3 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q499Y3 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q499Y3 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q499Y3 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q499Y3 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q499Y3 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q499Y3 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q499Y3 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q499Y3 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q499Y3 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q499Y3 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q499Y3 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q499Y3 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q499Y3 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q499Y3 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q499Y3 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q499Y3 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Q499Y3 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q499Y3 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Q499Y3 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q499Y3 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q499Y3 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q499Y3 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Q499Y3 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q499Y3 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q499Y3 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q499Y3 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q499Y3 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q499Y3 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q499Y3 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q499Y3 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q499Y3 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q499Y3 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q499Y3 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q499Y3 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q499Y3 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q499Y3 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q499Y3 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q499Y3 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q499Y3 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q499Y3 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q499Y3 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q499Y3 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q499Y3 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q499Y3 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q499Y3 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q499Y3 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q499Y3 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q499Y3 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q499Y3 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q499Y3 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q499Y3 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q499Y3 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q499Y3 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Q499Y3 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q499Y3 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q499Y3 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q499Y3 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q499Y3 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q499Y3 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q499Y3 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q499Y3 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q499Y3 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q499Y3 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q499Y3 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q499Y3 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q499Y3 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q499Y3 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q499Y3 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q499Y3 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Q499Y3 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q499Y3 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q499Y3 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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