Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TTLL9Q3SXZ7 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TTLL9Q3SXZ7 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms