Protein–RNA interactions for Protein: Q309B1

TRIM16L, Tripartite motif-containing protein 16-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM16LQ309B1 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM16LQ309B1 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms