Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
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GEN1Q17RS7 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GEN1Q17RS7 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
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