Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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RTL8BQ17RB0 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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RTL8BQ17RB0 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RTL8BQ17RB0 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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