Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
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