Protein–RNA interactions for Protein: Q16836

HADH, Hydroxyacyl-coenzyme A dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHQ16836 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HADHQ16836 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HADHQ16836 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HADHQ16836 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HADHQ16836 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HADHQ16836 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HADHQ16836 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HADHQ16836 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HADHQ16836 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HADHQ16836 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HADHQ16836 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HADHQ16836 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HADHQ16836 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HADHQ16836 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HADHQ16836 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HADHQ16836 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HADHQ16836 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HADHQ16836 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
HADHQ16836 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HADHQ16836 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HADHQ16836 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HADHQ16836 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HADHQ16836 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HADHQ16836 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HADHQ16836 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HADHQ16836 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HADHQ16836 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HADHQ16836 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HADHQ16836 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
HADHQ16836 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HADHQ16836 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HADHQ16836 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HADHQ16836 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HADHQ16836 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HADHQ16836 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HADHQ16836 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
HADHQ16836 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HADHQ16836 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HADHQ16836 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HADHQ16836 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HADHQ16836 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HADHQ16836 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HADHQ16836 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HADHQ16836 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HADHQ16836 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HADHQ16836 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HADHQ16836 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HADHQ16836 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HADHQ16836 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HADHQ16836 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HADHQ16836 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HADHQ16836 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HADHQ16836 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HADHQ16836 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HADHQ16836 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HADHQ16836 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HADHQ16836 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HADHQ16836 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HADHQ16836 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HADHQ16836 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HADHQ16836 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HADHQ16836 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HADHQ16836 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HADHQ16836 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HADHQ16836 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HADHQ16836 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HADHQ16836 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HADHQ16836 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HADHQ16836 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HADHQ16836 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HADHQ16836 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HADHQ16836 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HADHQ16836 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HADHQ16836 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HADHQ16836 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HADHQ16836 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HADHQ16836 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HADHQ16836 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HADHQ16836 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HADHQ16836 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HADHQ16836 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HADHQ16836 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HADHQ16836 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HADHQ16836 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HADHQ16836 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HADHQ16836 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HADHQ16836 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HADHQ16836 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HADHQ16836 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HADHQ16836 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HADHQ16836 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
HADHQ16836 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HADHQ16836 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HADHQ16836 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HADHQ16836 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
HADHQ16836 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
HADHQ16836 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HADHQ16836 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HADHQ16836 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HADHQ16836 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
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