Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
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ECM1Q16610 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
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ECM1Q16610 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
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ECM1Q16610 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
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