Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
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ZNF239Q16600 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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ZNF239Q16600 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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ZNF239Q16600 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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ZNF239Q16600 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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ZNF239Q16600 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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ZNF239Q16600 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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ZNF239Q16600 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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ZNF239Q16600 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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ZNF239Q16600 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF239Q16600 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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