Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
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SGCAQ16586 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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SGCAQ16586 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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SGCAQ16586 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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SGCAQ16586 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCAQ16586 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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