Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
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