Protein–RNA interactions for Protein: Q16526

CRY1, Cryptochrome-1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY1Q16526 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRY1Q16526 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CRY1Q16526 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRY1Q16526 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRY1Q16526 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRY1Q16526 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRY1Q16526 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRY1Q16526 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRY1Q16526 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
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CRY1Q16526 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
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CRY1Q16526 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRY1Q16526 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRY1Q16526 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRY1Q16526 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRY1Q16526 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRY1Q16526 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRY1Q16526 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRY1Q16526 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRY1Q16526 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRY1Q16526 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRY1Q16526 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRY1Q16526 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRY1Q16526 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRY1Q16526 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CRY1Q16526 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CRY1Q16526 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRY1Q16526 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRY1Q16526 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRY1Q16526 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRY1Q16526 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRY1Q16526 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRY1Q16526 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRY1Q16526 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRY1Q16526 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRY1Q16526 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRY1Q16526 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRY1Q16526 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRY1Q16526 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRY1Q16526 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRY1Q16526 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
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CRY1Q16526 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
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CRY1Q16526 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
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CRY1Q16526 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
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CRY1Q16526 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
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CRY1Q16526 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRY1Q16526 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRY1Q16526 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
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CRY1Q16526 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
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CRY1Q16526 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRY1Q16526 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRY1Q16526 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRY1Q16526 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRY1Q16526 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
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CRY1Q16526 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
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CRY1Q16526 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRY1Q16526 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRY1Q16526 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
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CRY1Q16526 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRY1Q16526 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRY1Q16526 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRY1Q16526 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRY1Q16526 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRY1Q16526 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRY1Q16526 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRY1Q16526 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRY1Q16526 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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