Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GRIK5Q16478 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
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