Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
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LAMA4Q16363 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
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