Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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ZFHX3Q15911 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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ZFHX3Q15911 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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ZFHX3Q15911 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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ZFHX3Q15911 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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ZFHX3Q15911 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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ZFHX3Q15911 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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ZFHX3Q15911 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ZFHX3Q15911 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZFHX3Q15911 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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