Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SIX1Q15475 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
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