Protein–RNA interactions for Protein: Q15464

SHB, SH2 domain-containing adapter protein B, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHBQ15464 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SHBQ15464 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SHBQ15464 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SHBQ15464 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SHBQ15464 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SHBQ15464 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHBQ15464 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHBQ15464 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHBQ15464 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHBQ15464 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHBQ15464 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHBQ15464 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHBQ15464 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHBQ15464 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHBQ15464 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHBQ15464 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHBQ15464 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHBQ15464 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHBQ15464 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHBQ15464 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHBQ15464 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHBQ15464 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SHBQ15464 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHBQ15464 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHBQ15464 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHBQ15464 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHBQ15464 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHBQ15464 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHBQ15464 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHBQ15464 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SHBQ15464 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHBQ15464 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHBQ15464 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHBQ15464 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHBQ15464 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHBQ15464 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHBQ15464 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHBQ15464 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHBQ15464 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHBQ15464 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHBQ15464 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHBQ15464 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SHBQ15464 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SHBQ15464 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHBQ15464 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SHBQ15464 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHBQ15464 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHBQ15464 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHBQ15464 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHBQ15464 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHBQ15464 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHBQ15464 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHBQ15464 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHBQ15464 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHBQ15464 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHBQ15464 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHBQ15464 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SHBQ15464 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHBQ15464 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SHBQ15464 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHBQ15464 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHBQ15464 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHBQ15464 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHBQ15464 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHBQ15464 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SHBQ15464 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SHBQ15464 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SHBQ15464 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SHBQ15464 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SHBQ15464 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SHBQ15464 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SHBQ15464 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SHBQ15464 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SHBQ15464 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SHBQ15464 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SHBQ15464 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SHBQ15464 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SHBQ15464 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SHBQ15464 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SHBQ15464 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SHBQ15464 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SHBQ15464 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SHBQ15464 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SHBQ15464 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SHBQ15464 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SHBQ15464 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SHBQ15464 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SHBQ15464 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SHBQ15464 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SHBQ15464 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SHBQ15464 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SHBQ15464 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SHBQ15464 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SHBQ15464 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SHBQ15464 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SHBQ15464 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SHBQ15464 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SHBQ15464 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SHBQ15464 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SHBQ15464 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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