Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SEC23BQ15437 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SEC23BQ15437 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms