Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SYCP1Q15431 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
SYCP1Q15431 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
SYCP1Q15431 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
SYCP1Q15431 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
SYCP1Q15431 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.75
SYCP1Q15431 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
SYCP1Q15431 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SYCP1Q15431 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SYCP1Q15431 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SYCP1Q15431 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SYCP1Q15431 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SYCP1Q15431 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SYCP1Q15431 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SYCP1Q15431 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SYCP1Q15431 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SYCP1Q15431 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SYCP1Q15431 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SYCP1Q15431 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SYCP1Q15431 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SYCP1Q15431 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SYCP1Q15431 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SYCP1Q15431 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SYCP1Q15431 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SYCP1Q15431 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SYCP1Q15431 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SYCP1Q15431 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SYCP1Q15431 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SYCP1Q15431 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SYCP1Q15431 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SYCP1Q15431 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SYCP1Q15431 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SYCP1Q15431 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SYCP1Q15431 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYCP1Q15431 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYCP1Q15431 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYCP1Q15431 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYCP1Q15431 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYCP1Q15431 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
SYCP1Q15431 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYCP1Q15431 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYCP1Q15431 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYCP1Q15431 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYCP1Q15431 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYCP1Q15431 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
SYCP1Q15431 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYCP1Q15431 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYCP1Q15431 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYCP1Q15431 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYCP1Q15431 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYCP1Q15431 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYCP1Q15431 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYCP1Q15431 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYCP1Q15431 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYCP1Q15431 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYCP1Q15431 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYCP1Q15431 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYCP1Q15431 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SYCP1Q15431 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SYCP1Q15431 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
SYCP1Q15431 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SYCP1Q15431 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
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