Protein–RNA interactions for Protein: Q15388

TOMM20, Mitochondrial import receptor subunit TOM20 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOMM20Q15388 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TOMM20Q15388 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TOMM20Q15388 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TOMM20Q15388 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TOMM20Q15388 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TOMM20Q15388 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TOMM20Q15388 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TOMM20Q15388 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TOMM20Q15388 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TOMM20Q15388 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TOMM20Q15388 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TOMM20Q15388 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TOMM20Q15388 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TOMM20Q15388 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TOMM20Q15388 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TOMM20Q15388 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TOMM20Q15388 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TOMM20Q15388 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TOMM20Q15388 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TOMM20Q15388 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TOMM20Q15388 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TOMM20Q15388 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TOMM20Q15388 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TOMM20Q15388 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TOMM20Q15388 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TOMM20Q15388 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TOMM20Q15388 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TOMM20Q15388 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TOMM20Q15388 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TOMM20Q15388 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TOMM20Q15388 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TOMM20Q15388 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TOMM20Q15388 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TOMM20Q15388 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TOMM20Q15388 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TOMM20Q15388 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TOMM20Q15388 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TOMM20Q15388 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TOMM20Q15388 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
TOMM20Q15388 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
TOMM20Q15388 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TOMM20Q15388 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
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