Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SEMA3AQ14563 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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