Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

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Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CKAP5Q14008 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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CKAP5Q14008 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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CKAP5Q14008 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CKAP5Q14008 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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